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Introduction: Blood pressure (BP) is a highly heritable trait with over 2000 underlying genomic loci identified to date. Although the kidney plays a key role, little is known about specific cell types involved in the genetic regulation of BP. Methods: Here, we applied stratified linkage disequilibrium score (LDSC) regression to connect BP genome-wide association studies (GWAS) results to specific cell types of the mature human kidney. We used the largest single-stage BP genome-wide analysis to date, including up to 1,028,980 adults of European ancestry, and single-cell transcriptomic data from 14 mature human kidneys, with mean age of 41 years. Results: Our analyses prioritized myofibroblasts and endothelial cells, among the total of 33 annotated cell type, as specifically involved in BP regulation (P < 0.05/33, i.e., 0.001515). Enrichment of heritability for systolic BP (SBP) was observed in myofibroblast cells in mature human kidney cortex, and enrichment of heritability for diastolic BP (DBP) was observed in descending vasa recta and peritubular capillary endothelial cells as well as stromal myofibroblast cells. The new finding of myofibroblast, the significant cell type for both BP traits, was consistent in 8 replication efforts using 7 sets of independent data, including in human fetal kidney, in East-Asian (EAS) ancestry, using mouse single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data, and when using another prioritization method. Conclusion: Our findings provide a solid basis for follow-up studies to further identify genes and mechanisms in myofibroblast cells that underlie the regulation of BP.
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure / Ganji-Arjenaki, M.; Kamali, Z.; Evangelou, E.; Warren, H. R.; Gao, H.; Ntritsos, G.; Dimou, N.; Esko, T.; Magi, R.; Milani, L.; Almgren, P.; Boutin, T.; Debette, S.; Ding, J.; Giulianini, F.; Holliday, E. G.; Jackson, A. U.; Li -Gao, R.; Lin, W. -Y.; Luan, J.; Mangino, M.; Oldmeadow, C.; Prins, B. P.; Qian, Y.; Sargurupremraj, M.; Shah, N.; Surendran, P.; Theriault, S.; Verweij, N.; Willems, S. M.; Zhao, J. -H.; Amouyel, P.; Connell, J.; de Mutsert, R.; Doney, A. S. F.; Farrall, M.; Menni, C.; Morris, A. D.; Noordam, R.; Pare, G.; Poulter, N. R.; Shields, D. C.; Stanton, A.; Thom, S.; Abecasis, G.; Amin, N.; Arking, D. E.; Ayers, K. L.; Barbieri, C. M.; Batini, C.; Bis, J. C.; Blake, T.; Bochud, M.; Boehnke, M.; Boerwinkle, E.; Boomsma, D. I.; Bottinger, E. P.; Braund, P. S.; Brumat, M.; Campbell, A.; Campbell, H.; Chakravarti, A.; Chambers, J. C.; Chauhan, G.; Ciullo, M.; Cocca, M.; Collins, F.; Cordell, H. J.; Davies, G.; de Borst, M. H.; de Geus, E. J.; Deary, I. J.; Deelen, J.; Del Greco M, F.; Demirkale, C. Y.; Dorr, M.; Ehret, G. B.; Elosua, R.; Enroth, S.; Erzurumluoglu, A. M.; Ferreira, T.; Franberg, M.; Franco, O. H.; Gandin, I.; Gasparini, P.; Giedraitis, V.; Gieger, C.; Girotto, G.; Goel, A.; Gow, A. J.; Gudnason, V.; Guo, X.; Gyllensten, U.; Hamsten, A.; Harris, T. B.; Harris, S. E.; Hartman, C. A.; Havulinna, A. S.; Hicks, A. A.; Hofer, E.; Hofman, A.; Hottenga, J. -J.; Huffman, J. E.; Hwang, S. -J.; Ingelsson, E.; James, A.; Jansen, R.; Jarvelin, M. -R.; Joehanes, R.; Johansson, A.; Johnson, A. D.; Joshi, P. K.; Jousilahti, P.; Jukema, J. W.; Jula, A.; Kahonen, M.; Kathiresan, S.; Keavney, B. D.; Khaw, K. -T.; Knekt, P.; Knight, J.; Kolcic, I.; Kooner, J. S.; Koskinen, S.; Kristiansson, K.; Kutalik, Z.; Laan, M.; Larson, M.; Launer, L. J.; Lehne, B.; Lehtimaki, T.; Liewald, D. C. M.; Lin, L.; Lind, L.; Lindgren, C. M.; Liu, Y.; Loos, R. J. F.; Lopez, L. M.; Lu, Y.; Lyytikainen, L. -P.; Mahajan, A.; Mamasoula, C.; Marrugat, J.; Marten, J.; Milaneschi, Y.; Morgan, A.; Morris, A. P.; Morrison, A. C.; Munson, P. J.; Nalls, M. A.; Nandakumar, P.; Nelson, C. P.; Niiranen, T.; Nolte, I. M.; Nutile, T.; Oldehinkel, A. J.; Oostra, B. A.; O'Reilly, P. F.; Org, E.; Padmanabhan, S.; Palmas, W.; Palotie, A.; Pattie, A.; Penninx, B. W. J. H.; Perola, M.; Peters, A.; Polasek, O.; Pramstaller, P. P.; Nguyen, Q. T.; Raitakari, O. T.; Rettig, R.; Rice, K.; Ridker, P. M.; Ried, J. S.; Riese, H.; Ripatti, S.; Robino, A.; Rose, L. M.; Rotter, J. I.; Rudan, I.; Ruggiero, D.; Saba, Y.; Sala, C. F.; Salomaa, V.; Samani, N. J.; Sarin, A. -P.; Schmidt, R.; Schmidt, H.; Shrine, N.; Siscovick, D.; Smith, A. V.; Snieder, H.; Sober, S.; Sorice, R.; Starr, J. M.; Stott, D. J.; Strachan, D. P.; Strawbridge, R. J.; Sundstrom, J.; Swertz, M. A.; Taylor, K. D.; Teumer, A.; Tobin, M. D.; Tomaszewski, M.; Toniolo, D.; Traglia, M.; Trompet, S.; Tuomilehto, J.; Tzourio, C.; Uitterlinden, A. G.; Vaez, A.; van der Most, P. J.; van Duijn, C. M.; Verwoert, G. C.; Vitart, V.; Volker, U.; Vollenweider, P.; Vuckovic, D.; Watkins, H.; Wild, S. H.; Willemsen, G.; Wilson, J. F.; Wright, A. F.; Yao, J.; Zemunik, T.; Zhang, W.; Attia, J. R.; Butterworth, A. S.; Chasman, D. I.; Conen, D.; Cucca, F.; Danesh, J.; Hayward, C.; Howson, J. M. M.; Laakso, M.; Lakatta, E. G.; Langenberg, C.; Melander, O.; Mook-Kanamori, D. O.; Palmer, C. N. A.; Risch, L.; Scott, R. A.; Scott, R. J.; Sever, P.; Spector, T. D.; van der Harst, P.; Wareham, N. J.; Zeggini, E.; Levy, D.; Munroe, P. B.; Newton-Cheh, C.; Brown, M. J.; Metspalu, A.; Psaty, B. M.; Wain, L. V.; Elliott, P.; Caulfield, M. J.; Sardari, S.; de Borst, M.. - In: KIDNEY INTERNATIONAL REPORTS. - ISSN 2468-0249. - 9:6(2024), pp. 1849-1859. [10.1016/j.ekir.2024.03.001]
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure
Ganji-Arjenaki M.;Kamali Z.;Evangelou E.;Warren H. R.;Gao H.;Ntritsos G.;Dimou N.;Esko T.;Magi R.;Milani L.;Almgren P.;Boutin T.;Debette S.;Ding J.;Giulianini F.;Holliday E. G.;Jackson A. U.;Li -Gao R.;Lin W. -Y.;Luan J.;Mangino M.;Oldmeadow C.;Prins B. P.;Qian Y.;Sargurupremraj M.;Shah N.;Surendran P.;Theriault S.;Verweij N.;Willems S. M.;Zhao J. -H.;Amouyel P.;Connell J.;de Mutsert R.;Doney A. S. F.;Farrall M.;Menni C.;Morris A. D.;Noordam R.;Pare G.;Poulter N. R.;Shields D. C.;Stanton A.;Thom S.;Abecasis G.;Amin N.;Arking D. E.;Ayers K. L.;Barbieri C. M.;Batini C.;Bis J. C.;Blake T.;Bochud M.;Boehnke M.;Boerwinkle E.;Boomsma D. I.;Bottinger E. P.;Braund P. S.;Brumat M.;Campbell A.;Campbell H.;Chakravarti A.;Chambers J. C.;Chauhan G.;Ciullo M.;Cocca M.;Collins F.;Cordell H. J.;Davies G.;de Borst M. H.;de Geus E. J.;Deary I. J.;Deelen J.;Del Greco M F.;Demirkale C. Y.;Dorr M.;Ehret G. B.;Elosua R.;Enroth S.;Erzurumluoglu A. M.;Ferreira T.;Franberg M.;Franco O. H.;Gandin I.;Gasparini P.;Giedraitis V.;Gieger C.;Girotto G.;Goel A.;Gow A. J.;Gudnason V.;Guo X.;Gyllensten U.;Hamsten A.;Harris T. B.;Harris S. E.;Hartman C. A.;Havulinna A. S.;Hicks A. A.;Hofer E.;Hofman A.;Hottenga J. -J.;Huffman J. E.;Hwang S. -J.;Ingelsson E.;James A.;Jansen R.;Jarvelin M. -R.;Joehanes R.;Johansson A.;Johnson A. D.;Joshi P. K.;Jousilahti P.;Jukema J. W.;Jula A.;Kahonen M.;Kathiresan S.;Keavney B. D.;Khaw K. -T.;Knekt P.;Knight J.;Kolcic I.;Kooner J. S.;Koskinen S.;Kristiansson K.;Kutalik Z.;Laan M.;Larson M.;Launer L. J.;Lehne B.;Lehtimaki T.;Liewald D. C. M.;Lin L.;Lind L.;Lindgren C. M.;Liu Y.;Loos R. J. F.;Lopez L. M.;Lu Y.;Lyytikainen L. -P.;Mahajan A.;Mamasoula C.;Marrugat J.;Marten J.;Milaneschi Y.;Morgan A.;Morris A. P.;Morrison A. C.;Munson P. J.;Nalls M. A.;Nandakumar P.;Nelson C. P.;Niiranen T.;Nolte I. M.;Nutile T.;Oldehinkel A. J.;Oostra B. A.;O'Reilly P. F.;Org E.;Padmanabhan S.;Palmas W.;Palotie A.;Pattie A.;Penninx B. W. J. H.;Perola M.;Peters A.;Polasek O.;Pramstaller P. P.;Nguyen Q. T.;Raitakari O. T.;Rettig R.;Rice K.;Ridker P. M.;Ried J. S.;Riese H.;Ripatti S.;Robino A.;Rose L. M.;Rotter J. I.;Rudan I.;Ruggiero D.;Saba Y.;Sala C. F.;Salomaa V.;Samani N. J.;Sarin A. -P.;Schmidt R.;Schmidt H.;Shrine N.;Siscovick D.;Smith A. V.;Snieder H.;Sober S.;Sorice R.;Starr J. M.;Stott D. J.;Strachan D. P.;Strawbridge R. J.;Sundstrom J.;Swertz M. A.;Taylor K. D.;Teumer A.;Tobin M. D.;Tomaszewski M.;Toniolo D.;Traglia M.;Trompet S.;Tuomilehto J.;Tzourio C.;Uitterlinden A. G.;Vaez A.;van der Most P. J.;van Duijn C. M.;Verwoert G. C.;Vitart V.;Volker U.;Vollenweider P.;Vuckovic D.;Watkins H.;Wild S. H.;Willemsen G.;Wilson J. F.;Wright A. F.;Yao J.;Zemunik T.;Zhang W.;Attia J. R.;Butterworth A. S.;Chasman D. I.;Conen D.;Cucca F.;Danesh J.;Hayward C.;Howson J. M. M.;Laakso M.;Lakatta E. G.;Langenberg C.;Melander O.;Mook-Kanamori D. O.;Palmer C. N. A.;Risch L.;Scott R. A.;Scott R. J.;Sever P.;Spector T. D.;van der Harst P.;Wareham N. J.;Zeggini E.;Levy D.;Munroe P. B.;Newton-Cheh C.;Brown M. J.;Metspalu A.;Psaty B. M.;Wain L. V.;Elliott P.;Caulfield M. J.;Sardari S.;de Borst M.
2024-01-01
Abstract
Introduction: Blood pressure (BP) is a highly heritable trait with over 2000 underlying genomic loci identified to date. Although the kidney plays a key role, little is known about specific cell types involved in the genetic regulation of BP. Methods: Here, we applied stratified linkage disequilibrium score (LDSC) regression to connect BP genome-wide association studies (GWAS) results to specific cell types of the mature human kidney. We used the largest single-stage BP genome-wide analysis to date, including up to 1,028,980 adults of European ancestry, and single-cell transcriptomic data from 14 mature human kidneys, with mean age of 41 years. Results: Our analyses prioritized myofibroblasts and endothelial cells, among the total of 33 annotated cell type, as specifically involved in BP regulation (P < 0.05/33, i.e., 0.001515). Enrichment of heritability for systolic BP (SBP) was observed in myofibroblast cells in mature human kidney cortex, and enrichment of heritability for diastolic BP (DBP) was observed in descending vasa recta and peritubular capillary endothelial cells as well as stromal myofibroblast cells. The new finding of myofibroblast, the significant cell type for both BP traits, was consistent in 8 replication efforts using 7 sets of independent data, including in human fetal kidney, in East-Asian (EAS) ancestry, using mouse single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) data, and when using another prioritization method. Conclusion: Our findings provide a solid basis for follow-up studies to further identify genes and mechanisms in myofibroblast cells that underlie the regulation of BP.
Prioritization of Kidney Cell Types Highlights Myofibroblast Cells in Regulating Human Blood Pressure / Ganji-Arjenaki, M.; Kamali, Z.; Evangelou, E.; Warren, H. R.; Gao, H.; Ntritsos, G.; Dimou, N.; Esko, T.; Magi, R.; Milani, L.; Almgren, P.; Boutin, T.; Debette, S.; Ding, J.; Giulianini, F.; Holliday, E. G.; Jackson, A. U.; Li -Gao, R.; Lin, W. -Y.; Luan, J.; Mangino, M.; Oldmeadow, C.; Prins, B. P.; Qian, Y.; Sargurupremraj, M.; Shah, N.; Surendran, P.; Theriault, S.; Verweij, N.; Willems, S. M.; Zhao, J. -H.; Amouyel, P.; Connell, J.; de Mutsert, R.; Doney, A. S. F.; Farrall, M.; Menni, C.; Morris, A. D.; Noordam, R.; Pare, G.; Poulter, N. R.; Shields, D. C.; Stanton, A.; Thom, S.; Abecasis, G.; Amin, N.; Arking, D. E.; Ayers, K. L.; Barbieri, C. M.; Batini, C.; Bis, J. C.; Blake, T.; Bochud, M.; Boehnke, M.; Boerwinkle, E.; Boomsma, D. I.; Bottinger, E. P.; Braund, P. S.; Brumat, M.; Campbell, A.; Campbell, H.; Chakravarti, A.; Chambers, J. C.; Chauhan, G.; Ciullo, M.; Cocca, M.; Collins, F.; Cordell, H. J.; Davies, G.; de Borst, M. H.; de Geus, E. J.; Deary, I. J.; Deelen, J.; Del Greco M, F.; Demirkale, C. Y.; Dorr, M.; Ehret, G. B.; Elosua, R.; Enroth, S.; Erzurumluoglu, A. M.; Ferreira, T.; Franberg, M.; Franco, O. H.; Gandin, I.; Gasparini, P.; Giedraitis, V.; Gieger, C.; Girotto, G.; Goel, A.; Gow, A. J.; Gudnason, V.; Guo, X.; Gyllensten, U.; Hamsten, A.; Harris, T. B.; Harris, S. E.; Hartman, C. A.; Havulinna, A. S.; Hicks, A. A.; Hofer, E.; Hofman, A.; Hottenga, J. -J.; Huffman, J. E.; Hwang, S. -J.; Ingelsson, E.; James, A.; Jansen, R.; Jarvelin, M. -R.; Joehanes, R.; Johansson, A.; Johnson, A. D.; Joshi, P. K.; Jousilahti, P.; Jukema, J. W.; Jula, A.; Kahonen, M.; Kathiresan, S.; Keavney, B. D.; Khaw, K. -T.; Knekt, P.; Knight, J.; Kolcic, I.; Kooner, J. S.; Koskinen, S.; Kristiansson, K.; Kutalik, Z.; Laan, M.; Larson, M.; Launer, L. J.; Lehne, B.; Lehtimaki, T.; Liewald, D. C. M.; Lin, L.; Lind, L.; Lindgren, C. M.; Liu, Y.; Loos, R. J. F.; Lopez, L. M.; Lu, Y.; Lyytikainen, L. -P.; Mahajan, A.; Mamasoula, C.; Marrugat, J.; Marten, J.; Milaneschi, Y.; Morgan, A.; Morris, A. P.; Morrison, A. C.; Munson, P. J.; Nalls, M. A.; Nandakumar, P.; Nelson, C. P.; Niiranen, T.; Nolte, I. M.; Nutile, T.; Oldehinkel, A. J.; Oostra, B. A.; O'Reilly, P. F.; Org, E.; Padmanabhan, S.; Palmas, W.; Palotie, A.; Pattie, A.; Penninx, B. W. J. H.; Perola, M.; Peters, A.; Polasek, O.; Pramstaller, P. P.; Nguyen, Q. T.; Raitakari, O. T.; Rettig, R.; Rice, K.; Ridker, P. M.; Ried, J. S.; Riese, H.; Ripatti, S.; Robino, A.; Rose, L. M.; Rotter, J. I.; Rudan, I.; Ruggiero, D.; Saba, Y.; Sala, C. F.; Salomaa, V.; Samani, N. J.; Sarin, A. -P.; Schmidt, R.; Schmidt, H.; Shrine, N.; Siscovick, D.; Smith, A. V.; Snieder, H.; Sober, S.; Sorice, R.; Starr, J. M.; Stott, D. J.; Strachan, D. P.; Strawbridge, R. J.; Sundstrom, J.; Swertz, M. A.; Taylor, K. D.; Teumer, A.; Tobin, M. D.; Tomaszewski, M.; Toniolo, D.; Traglia, M.; Trompet, S.; Tuomilehto, J.; Tzourio, C.; Uitterlinden, A. G.; Vaez, A.; van der Most, P. J.; van Duijn, C. M.; Verwoert, G. C.; Vitart, V.; Volker, U.; Vollenweider, P.; Vuckovic, D.; Watkins, H.; Wild, S. H.; Willemsen, G.; Wilson, J. F.; Wright, A. F.; Yao, J.; Zemunik, T.; Zhang, W.; Attia, J. R.; Butterworth, A. S.; Chasman, D. I.; Conen, D.; Cucca, F.; Danesh, J.; Hayward, C.; Howson, J. M. M.; Laakso, M.; Lakatta, E. G.; Langenberg, C.; Melander, O.; Mook-Kanamori, D. O.; Palmer, C. N. A.; Risch, L.; Scott, R. A.; Scott, R. J.; Sever, P.; Spector, T. D.; van der Harst, P.; Wareham, N. J.; Zeggini, E.; Levy, D.; Munroe, P. B.; Newton-Cheh, C.; Brown, M. J.; Metspalu, A.; Psaty, B. M.; Wain, L. V.; Elliott, P.; Caulfield, M. J.; Sardari, S.; de Borst, M.. - In: KIDNEY INTERNATIONAL REPORTS. - ISSN 2468-0249. - 9:6(2024), pp. 1849-1859. [10.1016/j.ekir.2024.03.001]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
