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Background - Studies of recurrent or subsequent disease events may be susceptible to bias caused by selection of subjects who both experience and survive the primary indexing event. Currently, the magnitude of any selection bias, particularly for subsequent time-to-event analysis in genetic association studies, is unknown. Methods and Results - We used empirically inspired simulation studies to explore the impact of selection bias on the marginal hazard ratio for risk of subsequent events among those with established coronary heart disease. The extent of selection bias was determined by the magnitudes of genetic and nongenetic effects on the indexing (first) coronary heart disease event. Unless the genetic hazard ratio was unrealistically large (>1.6 per allele) and assuming the sum of all nongenetic hazard ratios was <10, bias was usually <10% (downward toward the null). Despite the low bias, the probability that a confidence interval included the true effect decreased (undercoverage) with increasing sample size because of increasing precision. Importantly, false-positive rates were not affected by selection bias. Conclusions - In most empirical settings, selection bias is expected to have a limited impact on genetic effect estimates of subsequent event risk. Nevertheless, because of undercoverage increasing with sample size, most confidence intervals will be over precise (not wide enough). When there is no effect modification by history of coronary heart disease, the false-positive rates of association tests will be close to nominal.
Impact of Selection Bias on Estimation of Subsequent Event Risk / Hu, Y. -J.; Schmidt, A. F.; Dudbridge, F.; Holmes, M. V.; Brophy, J. M.; Tragante, V.; Li, Z.; Liao, P.; Quyyumi, A. A.; Mccubrey, R. O.; Horne, B. D.; Hingorani, A. D.; Asselbergs, F. W.; Patel, R. S.; Long, Q.; Akerblom, A.; Algra, A.; Allayee, H.; Almgren, P.; Anderson, J. L.; Andreassi, M. G.; Anselmi, C. V.; Ardissino, D.; Arsenault, B. J.; Ballantyne, C. M.; Baranova, E. V.; Behloui, H.; Bergmeijer, T. O.; Bezzina, C. R.; Bjornsson, E.; Body, S. C.; Boeckx, B.; Boersma, E. H.; Boerwinkle, E.; Bogaty, P.; Braund, P. S.; Breitling, L. P.; Brenner, H.; Briguori, C.; Brugts, J. J.; Burkhardt, R.; Cameron, V. A.; Carlquist, J. F.; Carpeggiani, C.; Carruthers, K. F.; Casu, G.; Condorelli, G.; Cresci, S.; Danchin, N.; De Faire, U.; Deanfield, J.; Delgado, G.; Deloukas, P.; Direk, K.; Doughty, R. N.; Drexel, H.; Duarte, N. E.; Dube, M. -P.; Dufresne, L.; Engert, J. C.; Eriksson, N.; Fitzpatrick, N.; Foco, L.; Ford, I.; Fox, K. A. A.; Gigante, B.; Gijsberts, C. M.; Girelli, D.; Gong, Y.; Gudbjartsson, D. F.; Hagstrom, E.; Hartiala, J.; Hazen, S. L.; Held, C.; Helgadottir, A.; Hemingway, H.; Heydarpour, M.; Hoefer, I. E.; Hovingh, K.; Hubacek, J. A.; James, S.; Johnson, J. A.; Jukema, J. W.; Kaczor, M. P.; Kaminski, K. A.; Kettner, J.; Kiliszek, M.; Kleber, M.; Klungel, O. H.; Kofink, D.; Kohonen, M.; Kotti, S.; Kuukasjarvi, P.; Lagerqvist, B.; Lambrechts, D.; Lang, C. C.; Laurikka, J. O.; Leander, K.; Lee, V. -V.; Lehtimaki, T.; Leiherer, A.; Lenzini, P. A.; Levin, D.; Lindholm, D.; Lokki, M. -L.; Lotufo, P. A.; Lyytikainen, L. -P.; Mahmoodi, B. K.; Maitland-Van Der Zee, A. H.; Martinelli, N.; Marz, W.; Marziliano, N.; Mcpherson, R.; Melander, O.; Mons, U.; Muehlschlegel, J. D.; Muhlestein, J. B.; Nelson, C. P.; Cheh, C. N.; Olivieri, O.; Opolski, G.; Palmer, C. N.; Pare, G.; Pasterkamp, G.; Pepine, C. J.; Pepinski, W.; Pereira, A. C.; Pilbrow, A. P.; Pilote, L.; Pitha, J.; Ploski, R.; Richards, A. M.; Saely, C. H.; Samani, N. J.; Samman-Tahhan, A.; Sanak, M.; Sandesara, P. B.; Sattar, N.; Scholz, M.; Siegbahn, A.; Simon, T.; Sinisalo, J.; Smith, J. G.; Spertus, J. A.; Stefansson, K.; Stewart, A. F. R.; Stott, D. J.; Szczeklik, W.; Szpakowicz, A.; Tanck, M. W. T.; Tang, W. H.; Tardif, J. -C.; Ten Berg, J. M.; Teren, A.; Thanassoulis, G.; Thiery, J.; Thorgeirsson, G.; Thorleifsson, G.; Thorsteinsdottir, U.; Timmis, A.; Trompet, S.; Van De Werf, F.; Van Der Graaf, Y.; Van Der Haarst, P.; Van Der Laan, S. W.; Vilmundarson, R. O.; Virani, S. S.; Visseren, F. L. J.; Vlachopoulou, E.; Wallentin, L.; Waltenberger, J.; Wauters, E.; Wilde, A. A. M.. - In: CIRCULATION, CARDIOVASCULAR GENETICS. - ISSN 1942-325X. - 10:5(2017). [10.1161/CIRCGENETICS.116.001616]
Impact of Selection Bias on Estimation of Subsequent Event Risk
Hu Y. -J.;Schmidt A. F.;Dudbridge F.;Holmes M. V.;Brophy J. M.;Tragante V.;Li Z.;Liao P.;Quyyumi A. A.;McCubrey R. O.;Horne B. D.;Hingorani A. D.;Asselbergs F. W.;Patel R. S.;Long Q.;Akerblom A.;Algra A.;Allayee H.;Almgren P.;Anderson J. L.;Andreassi M. G.;Anselmi C. V.;Ardissino D.;Arsenault B. J.;Ballantyne C. M.;Baranova E. V.;Behloui H.;Bergmeijer T. O.;Bezzina C. R.;Bjornsson E.;Body S. C.;Boeckx B.;Boersma E. H.;Boerwinkle E.;Bogaty P.;Braund P. S.;Breitling L. P.;Brenner H.;Briguori C.;Brugts J. J.;Burkhardt R.;Cameron V. A.;Carlquist J. F.;Carpeggiani C.;Carruthers K. F.;Casu G.;Condorelli G.;Cresci S.;Danchin N.;De Faire U.;Deanfield J.;Delgado G.;Deloukas P.;Direk K.;Doughty R. N.;Drexel H.;Duarte N. E.;Dube M. -P.;Dufresne L.;Engert J. C.;Eriksson N.;Fitzpatrick N.;Foco L.;Ford I.;Fox K. A. A.;Gigante B.;Gijsberts C. M.;Girelli D.;Gong Y.;Gudbjartsson D. F.;Hagstrom E.;Hartiala J.;Hazen S. L.;Held C.;Helgadottir A.;Hemingway H.;Heydarpour M.;Hoefer I. E.;Hovingh K.;Hubacek J. A.;James S.;Johnson J. A.;Jukema J. W.;Kaczor M. P.;Kaminski K. A.;Kettner J.;Kiliszek M.;Kleber M.;Klungel O. H.;Kofink D.;Kohonen M.;Kotti S.;Kuukasjarvi P.;Lagerqvist B.;Lambrechts D.;Lang C. C.;Laurikka J. O.;Leander K.;Lee V. -V.;Lehtimaki T.;Leiherer A.;Lenzini P. A.;Levin D.;Lindholm D.;Lokki M. -L.;Lotufo P. A.;Lyytikainen L. -P.;Mahmoodi B. K.;Maitland-Van Der Zee A. H.;Martinelli N.;Marz W.;Marziliano N.;McPherson R.;Melander O.;Mons U.;Muehlschlegel J. D.;Muhlestein J. B.;Nelson C. P.;Cheh C. N.;Olivieri O.;Opolski G.;Palmer C. N.;Pare G.;Pasterkamp G.;Pepine C. J.;Pepinski W.;Pereira A. C.;Pilbrow A. P.;Pilote L.;Pitha J.;Ploski R.;Richards A. M.;Saely C. H.;Samani N. J.;Samman-Tahhan A.;Sanak M.;Sandesara P. B.;Sattar N.;Scholz M.;Siegbahn A.;Simon T.;Sinisalo J.;Smith J. G.;Spertus J. A.;Stefansson K.;Stewart A. F. R.;Stott D. J.;Szczeklik W.;Szpakowicz A.;Tanck M. W. T.;Tang W. H.;Tardif J. -C.;Ten Berg J. M.;Teren A.;Thanassoulis G.;Thiery J.;Thorgeirsson G.;Thorleifsson G.;Thorsteinsdottir U.;Timmis A.;Trompet S.;Van De Werf F.;Van Der Graaf Y.;Van Der Haarst P.;Van Der Laan S. W.;Vilmundarson R. O.;Virani S. S.;Visseren F. L. J.;Vlachopoulou E.;Wallentin L.;Waltenberger J.;Wauters E.;Wilde A. A. M.
2017-01-01
Abstract
Background - Studies of recurrent or subsequent disease events may be susceptible to bias caused by selection of subjects who both experience and survive the primary indexing event. Currently, the magnitude of any selection bias, particularly for subsequent time-to-event analysis in genetic association studies, is unknown. Methods and Results - We used empirically inspired simulation studies to explore the impact of selection bias on the marginal hazard ratio for risk of subsequent events among those with established coronary heart disease. The extent of selection bias was determined by the magnitudes of genetic and nongenetic effects on the indexing (first) coronary heart disease event. Unless the genetic hazard ratio was unrealistically large (>1.6 per allele) and assuming the sum of all nongenetic hazard ratios was <10, bias was usually <10% (downward toward the null). Despite the low bias, the probability that a confidence interval included the true effect decreased (undercoverage) with increasing sample size because of increasing precision. Importantly, false-positive rates were not affected by selection bias. Conclusions - In most empirical settings, selection bias is expected to have a limited impact on genetic effect estimates of subsequent event risk. Nevertheless, because of undercoverage increasing with sample size, most confidence intervals will be over precise (not wide enough). When there is no effect modification by history of coronary heart disease, the false-positive rates of association tests will be close to nominal.
Impact of Selection Bias on Estimation of Subsequent Event Risk / Hu, Y. -J.; Schmidt, A. F.; Dudbridge, F.; Holmes, M. V.; Brophy, J. M.; Tragante, V.; Li, Z.; Liao, P.; Quyyumi, A. A.; Mccubrey, R. O.; Horne, B. D.; Hingorani, A. D.; Asselbergs, F. W.; Patel, R. S.; Long, Q.; Akerblom, A.; Algra, A.; Allayee, H.; Almgren, P.; Anderson, J. L.; Andreassi, M. G.; Anselmi, C. V.; Ardissino, D.; Arsenault, B. J.; Ballantyne, C. M.; Baranova, E. V.; Behloui, H.; Bergmeijer, T. O.; Bezzina, C. R.; Bjornsson, E.; Body, S. C.; Boeckx, B.; Boersma, E. H.; Boerwinkle, E.; Bogaty, P.; Braund, P. S.; Breitling, L. P.; Brenner, H.; Briguori, C.; Brugts, J. J.; Burkhardt, R.; Cameron, V. A.; Carlquist, J. F.; Carpeggiani, C.; Carruthers, K. F.; Casu, G.; Condorelli, G.; Cresci, S.; Danchin, N.; De Faire, U.; Deanfield, J.; Delgado, G.; Deloukas, P.; Direk, K.; Doughty, R. N.; Drexel, H.; Duarte, N. E.; Dube, M. -P.; Dufresne, L.; Engert, J. C.; Eriksson, N.; Fitzpatrick, N.; Foco, L.; Ford, I.; Fox, K. A. A.; Gigante, B.; Gijsberts, C. M.; Girelli, D.; Gong, Y.; Gudbjartsson, D. F.; Hagstrom, E.; Hartiala, J.; Hazen, S. L.; Held, C.; Helgadottir, A.; Hemingway, H.; Heydarpour, M.; Hoefer, I. E.; Hovingh, K.; Hubacek, J. A.; James, S.; Johnson, J. A.; Jukema, J. W.; Kaczor, M. P.; Kaminski, K. A.; Kettner, J.; Kiliszek, M.; Kleber, M.; Klungel, O. H.; Kofink, D.; Kohonen, M.; Kotti, S.; Kuukasjarvi, P.; Lagerqvist, B.; Lambrechts, D.; Lang, C. C.; Laurikka, J. O.; Leander, K.; Lee, V. -V.; Lehtimaki, T.; Leiherer, A.; Lenzini, P. A.; Levin, D.; Lindholm, D.; Lokki, M. -L.; Lotufo, P. A.; Lyytikainen, L. -P.; Mahmoodi, B. K.; Maitland-Van Der Zee, A. H.; Martinelli, N.; Marz, W.; Marziliano, N.; Mcpherson, R.; Melander, O.; Mons, U.; Muehlschlegel, J. D.; Muhlestein, J. B.; Nelson, C. P.; Cheh, C. N.; Olivieri, O.; Opolski, G.; Palmer, C. N.; Pare, G.; Pasterkamp, G.; Pepine, C. J.; Pepinski, W.; Pereira, A. C.; Pilbrow, A. P.; Pilote, L.; Pitha, J.; Ploski, R.; Richards, A. M.; Saely, C. H.; Samani, N. J.; Samman-Tahhan, A.; Sanak, M.; Sandesara, P. B.; Sattar, N.; Scholz, M.; Siegbahn, A.; Simon, T.; Sinisalo, J.; Smith, J. G.; Spertus, J. A.; Stefansson, K.; Stewart, A. F. R.; Stott, D. J.; Szczeklik, W.; Szpakowicz, A.; Tanck, M. W. T.; Tang, W. H.; Tardif, J. -C.; Ten Berg, J. M.; Teren, A.; Thanassoulis, G.; Thiery, J.; Thorgeirsson, G.; Thorleifsson, G.; Thorsteinsdottir, U.; Timmis, A.; Trompet, S.; Van De Werf, F.; Van Der Graaf, Y.; Van Der Haarst, P.; Van Der Laan, S. W.; Vilmundarson, R. O.; Virani, S. S.; Visseren, F. L. J.; Vlachopoulou, E.; Wallentin, L.; Waltenberger, J.; Wauters, E.; Wilde, A. A. M.. - In: CIRCULATION, CARDIOVASCULAR GENETICS. - ISSN 1942-325X. - 10:5(2017). [10.1161/CIRCGENETICS.116.001616]
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simulazione ASN
Il report seguente simula gli indicatori relativi alla propria produzione scientifica in relazione alle soglie ASN 2023-2025 del proprio SC/SSD. Si ricorda che il superamento dei valori soglia (almeno 2 su 3) è requisito necessario ma non sufficiente al conseguimento dell'abilitazione. La simulazione si basa sui dati IRIS e sugli indicatori bibliometrici alla data indicata e non tiene conto di eventuali periodi di congedo obbligatorio, che in sede di domanda ASN danno diritto a incrementi percentuali dei valori. La simulazione può differire dall'esito di un’eventuale domanda ASN sia per errori di catalogazione e/o dati mancanti in IRIS, sia per la variabilità dei dati bibliometrici nel tempo. Si consideri che Anvur calcola i valori degli indicatori all'ultima data utile per la presentazione delle domande.
La presente simulazione è stata realizzata sulla base delle specifiche raccolte sul tavolo ER del Focus Group IRIS coordinato dall’Università di Modena e Reggio Emilia e delle regole riportate nel DM 589/2018 e allegata Tabella A. Cineca, l’Università di Modena e Reggio Emilia e il Focus Group IRIS non si assumono alcuna responsabilità in merito all’uso che il diretto interessato o terzi faranno della simulazione. Si specifica inoltre che la simulazione contiene calcoli effettuati con dati e algoritmi di pubblico dominio e deve quindi essere considerata come un mero ausilio al calcolo svolgibile manualmente o con strumenti equivalenti.
