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The mutation point of view of the SARS-CoV-2 HV.1 lineage 1-gen-2024 Ciccozzi, Alessandra; Fiori, Pier Luigi; Casu, Marco; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo; Scarpa, Fabio
Draft genome of three isolates of Listeria monocytogenes isolated from Stenella coeruleoalba in Italy 1-gen-2024 Scarpa, Fabio; Grattarola, Carla; Arillo, Alessandra; Mattioda, Virginia; Testori, Camilla; Terracciano, Giuliana; Senese, Matteo; Giorda, Federica; Zoppi, Simona; Sanna, Daria; Casu, Marco; Peletto, Simone
Reconstructing the Evolutionary History of Pinna nobilis: New Genetic Signals from the Past of a Species on the Brink of Extinction 1-gen-2024 Sanna, Daria; Azzena, Ilenia; Locci, Chiara; Ankon, Pavel; Kruži´c, Petar; Manfrin, Chiara; Pallavicini, Alberto; Ciriaco, Saul; Segarich, Marco; Batistini, Edoardo; Scarpa, Fabio; Casu, Marco
The Global Evolutionary History of Orf Virus in Sheep and Goats Revealed by Whole Genomes Data 1-gen-2024 Coradduzza, Elisabetta; Scarpa, Fabio; Maria Rocchigiani, Angela; Cacciotto, Carla; Lostia, Giada; Stefania Fiori, Mariangela; Rodriguez Valera, Yoel; Mistral De Pascali, Alessandra; Brandolini, Martina; Azzena, Ilenia; Locci, Chiara; Casu, Marco; Bechere, Roberto; Pintus, Davide; Ligios, Ciriaco; Scagliarini, Alessandra; Sanna, Daria; Puggioni, Giantonella
Phylodynamic and Evolution of the Hemagglutinin (HA) and Neuraminidase (NA) Genes of Influenza A(H1N1) pdm09 Viruses Circulating in the 2009 and 2023 Seasons in Italy 1-gen-2024 Scarpa, Fabio; Sernicola, Leonardo; Farcomeni, Stefania; Ciccozzi, Alessandra; Sanna, Daria; Casu, Marco; Vitale, Marco; Cicenia, Alessia; Giovanetti, Marta; Romano, Chiara; Branda, Francesco; Ciccozzi, Massimo; Borsetti, Alessandra
Molecular In-Depth on the Epidemiological Expansion of SARS-CoV-2 XBB.1.5 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Azzena, Ilenia; Locci, Chiara; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Ciccozzi, Alessandra; Angeletti, Silvia; Imperia, Elena; Giovanetti, Marta; Maruotti, Antonello; Borsetti, Alessandra; Cauda, Roberto; Cassone, Antonio; Via, Allegra; Pascarella, Stefano; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo
Mitochondrial DNA Variation among Dogs of Mongolian, Tuvinian and Altaic Nomads 1-gen-2023 Sanna, Daria; Azzena, Ilenia; Cossu, Piero; Scarpa, Fabio; Scandura, Massimo; Apollonio, Marco; Lugli, Francesca; Francalacci, Paolo; Mereu, Paolo; Casu, Marco
Genome‐based comparison between the recombinant SARS‐CoV‐2 XBB and its parental lineages 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Sanna, Daria; Azzena, Ilenia; Casu, Marco; Cossu, Piero; Fiori, Pier Luigi; Benvenuto, Domenico; Imperia, Elena; Giovanetti, Marta; Ceccarelli, Giancarlo; Cauda, Roberto; Cassone, Antonio; Pascarella, Stefano; Ciccozzi, Massimo
The characterization of toll‐like receptor repertoire in Pinna nobilis after mass mortality events suggests adaptive introgression 1-gen-2023 Coupé, Stéphane; Giantsis, Ioannis A.; Vázquez , ; Luis, Maite; Scarpa, Fabio; Foulquié, Mathieu; Prévot, Jean‐marc; Casu, Marco; Lattos, Athanasios; Michaelidis, Basile; Sanna, Daria; García‐march, José Rafa; Tena‐medialdea, José; Vicente, Nardo; Bunet, Robert
SARS-CoV CH.1.1 Variant: Genomic and Structural Insight 1-gen-2023 Bazzani, Liliana; Imperia, Elena; Scarpa, Fabio; Sanna, Daria; Casu, Marco; Borsetti, Alessandra; Pascarella, Stefano; Petrosillo, Nicola; Cella, Eleonora; Giovanetti, Marta; Ciccozzi, Massimo
Epidemic history and evolution of an emerging threat of international concern, the severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 1-gen-2023 Giovanetti, Marta; Branda, Francesco; Cella, Eleonora; Scarpa, Fabio; Bazzani, Liliana; Ciccozzi, Alessandra; Slavov, Svetoslav Nanev; Benvenuto, Domenico; Sanna, Daria; Casu, Marco; Santos, Luciane Amorim; Lai, Alessia; Zehender, Giangluglielmo; Caccuri, Francesca; Ianni, Andrea; Caruso, Arnaldo; Maroutti, Antonello; Pascarella, Stefano; Borsetti, Alessandra; Ciccozzi, Massimo
Genetic and structural analyses reveal the low potential of the SARS-CoV-2 EG.5 variant 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Pascarella, Stefano; Ciccozzi, Alessandra; Giovanetti, Marta; Azzena, Ilenia; Locci, Chiara; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Quaranta, Miriana; Cella, Eleonora; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo
Avian influenza A H5N1: are we really sure it is a spillover? 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Sanna, Daria; Giovanetti, Marta; Pascarella, Stefano; Casu, Marco; Ciccozzi, Massimo
SARS-CoV-2 Recombinants: Genomic Comparison between XBF and Its Parental Lineages 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Locci, Chiara; Azzena, Ilenia; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Ciccozzi, Alessandra; Giovanetti, Marta; Quaranta, Miriana; Ceccarelli, Giancarlo; Pascarella, Stefano; Ciccozzi, Massimo; Sanna, Daria
Update on the Phylodynamic and Genetic Variability of Marburg Virus 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Bazzani, Liliana; Giovanetti, Marta; Ciccozzi, Alessandra; Benedetti, Francesca; Zella, Davide; Sanna, Daria; Casu, Marco; Borsetti, Alessandra; Cella, Eleonora; Pascarella, Stefano; Maruotti, Antonello; Ciccozzi, Massimo
Integrative Genome-Based Survey of the SARS-CoV-2 Omicron XBB.1.16 Variant 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Azzena, Ilenia; Ciccozzi, Alessandra; Giovanetti, Marta; Locci, Chiara; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Borsetti, Alessandra; Cella, Eleonora; Quaranta, Miriana; Pascarella, Stefano; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo
Multipathogen infections and multifactorial pathogenesis involved in noble pen shell (Pinna nobilis) mass mortality events: Background and current pathologic approaches 1-gen-2023 Carella, Francesca; Palić, Dušan; Šarić, Tomislav; Župan, Ivan; Gorgoglione, Bartolomeo; Prado, Patricia; Andree, Karl B.; Giantsis, Ioannis A.; Michaelidis, Basile; Lattos, Athanasios; Theodorou, John A.; Luis Barja Perez, Juan; Rodriguez, Sergio; Scarpa, Fabio; Casu, Marco; Antuofermo, Elisabetta; Sanna, Daria; Otranto, Domenico; Panarese, Rossella; Iaria, Carmelo; Marino, Fabio; DE VICO, Gionata
Genetic and structural genome-based survey reveals the low potential for epidemiological expansion of the SARS-CoV-2 XBB.1.5 sublineage 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Imperia, Elena; Azzena, Ilenia; Giovanetti, Marta; Benvenuto, Domenico; Locci, Chiara; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Maruotti, Antonello; Ceccarelli, Giancarlo; Borsetti, Alessandra; Caruso, Arnaldo; Cauda, Roberto; Cassone, Antonio; Via, Allegra; Pascarella, Stefano; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo
Genome-based survey of the SARS-CoV-2 BF.7 variant from Asia 1-gen-2023 Scarpa, Fabio; Giovanetti, Marta; Azzena, Ilenia; Locci, Chiara; Casu, Marco; Fiori, Pier Luigi; Ciccozzi, Alessandra; Imperia, Elena; Bazzani, Liliana; Borsetti, Alessandra; Maruotti, Antonello; Pascarella, Stefano; Sanna, Daria; Ciccozzi, Massimo
Appraising the Genetic Makeup of an Allochthonous Southern Pike Population: An Opportunity to Predict the Evolution of Introgressive Hybridization in Isolated Populations? 1-gen-2023 Casu, Marco; Azzena, Ilenia; Scarpa, Fabio; Locci, Chiara; Niffoi, Alessio; Battista Delmastro, Giovanni; Lo Conte, Paolo; Varcasia, Antonio; Bovero, Stefano; Candiotto, Alessandro; Sanna, Daria; Cossu, Piero
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